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阿拉比卡咖啡的也门家族树,以保护它免受气候变化的影响

2024-05-04 09:44 来源:得道网

研究人员绘制了世界上最受欢迎的咖啡阿拉比卡的家族史,这可能有助于保护它免受未来气候变化的影响。

它证实了阿拉比卡咖啡最早是在也门种植的,现代品种起源于那里。

它的起源可以追溯到近100万年前,这幅地图显示了这种作物是如何在数千年的全球冷热气候变化中生存下来的,这使研究人员能够确定它能够持续繁荣的地点。

由于遗传多样性低,这种作物未来面临着被咖啡叶锈病等病原体大量消灭的风险。目前,咖啡叶锈病每年造成10亿到20亿美元的损失。

布法罗大学的研究结果发表在《自然遗传学》杂志上,通过绘制家谱,揭示了一种阿拉比卡咖啡品种是如何获得对这种疾病的强大抵抗力的。

东帝汶品种,也被称为罗布斯塔,是在东南亚形成的,是阿拉比卡咖啡和它的亲本之一,canephora咖啡之间的自然杂交品种,具有更强的抵抗力。

利用新的阿拉比卡参考基因组,研究人员可以确定一个包含RPP8抗性基因家族成员的新区域,以及抗性基因的一般调节因子CPR1,这将有助于确保这种作物的未来。

该研究的合著者、布法罗大学生物系的维克多·阿尔伯特教授说:“我们利用今天活着的植物的基因组信息来追溯过去,尽可能准确地描绘出阿拉比卡咖啡的悠久历史,并确定现代栽培品种之间的关系。”

“详细了解当代品种的起源和育种历史对于开发更好地适应气候变化的新阿拉比卡品种至关重要。”

利用尖端的DNA测序技术和先进的数据科学,该团队能够对39个阿拉比卡品种进行测序。

阿拉比卡咖啡是canephora咖啡和eugenioides咖啡的自然杂交产物。

科学家们一直在努力确定这一事件发生的确切时间和地点,估计范围从1万到100万年前不等。

为了找到原始事件的证据,研究人员通过一个计算模型程序运行了他们的各种阿拉比卡基因组,以寻找物种基础的特征。

这些模型显示了阿拉比卡咖啡历史上的三次人口瓶颈,最古老的一次发生在大约29000代人——61万年前。研究人员说,这表明阿拉比卡咖啡形成于此之前的某个时间,大约在61万到100万年前。

“换句话说,创造阿拉比卡咖啡的杂交不是人类做过的事情,”阿尔伯特说。

“很明显,这一事件早于现代人和咖啡的种植。”

研究人员说,长期以来,人们一直认为咖啡树是在埃塞俄比亚发展起来的,但研究小组在东非大裂谷(从非洲东南部延伸到亚洲)周围收集的品种显示出明显的地理分裂。

研究的野生品种都起源于西侧,而栽培品种都起源于最靠近非洲和也门之间的曼德海峡的东侧。

“看起来也门咖啡的多样性可能是目前所有主要品种的创始人,”该研究的联合负责人、雀巢研究公司基因组学高级专家帕特里克·德斯库姆斯说。

“咖啡不是一种像玉米或小麦那样经过大量杂交来创造新品种的作物。”

研究人员的模型显示了东非的气候事件是如何影响这种作物的。

从2万到10万年前的低人口规模,大致与4万到7万年前袭击该地区的长期干旱和较冷的气候相吻合,它的人口在非洲湿润时期增加,大约6000到1.5万年前,当时的生长条件可能更有利。

阿拉比卡咖啡(Arabica coffee)以其柔滑和相对甜味而备受推崇,目前占全球咖啡市场的60%至70%,由星巴克(Starbucks)、蒂姆·霍顿(Tim Horton’s)和唐恩甜甜圈(Dunkin’Donuts)等公司酿造。剩下的是罗布斯塔咖啡(robusta),这是一种更浓烈、更苦的咖啡,由阿拉比卡咖啡的祖先之一canephora咖啡制成。

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